Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX3P26022 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX3P26022 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX3P26022 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX3P26022 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX3P26022 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTX3P26022 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTX3P26022 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX3P26022 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX3P26022 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX3P26022 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTX3P26022 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTX3P26022 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX3P26022 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX3P26022 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX3P26022 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX3P26022 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTX3P26022 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTX3P26022 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTX3P26022 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTX3P26022 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTX3P26022 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTX3P26022 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX3P26022 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX3P26022 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX3P26022 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX3P26022 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX3P26022 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTX3P26022 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTX3P26022 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTX3P26022 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTX3P26022 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTX3P26022 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTX3P26022 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTX3P26022 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTX3P26022 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTX3P26022 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTX3P26022 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTX3P26022 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTX3P26022 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTX3P26022 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTX3P26022 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms