Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA3P26006 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA3P26006 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA3P26006 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA3P26006 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms