Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSSP25774 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSSP25774 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSSP25774 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSSP25774 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSSP25774 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTSSP25774 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSSP25774 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSSP25774 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSSP25774 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSSP25774 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSSP25774 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSSP25774 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSSP25774 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSSP25774 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSSP25774 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSSP25774 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSSP25774 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSSP25774 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSSP25774 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSSP25774 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSSP25774 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSSP25774 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSSP25774 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSSP25774 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSSP25774 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSSP25774 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSSP25774 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSSP25774 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSSP25774 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSSP25774 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSSP25774 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSSP25774 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSSP25774 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms