Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTAFRP25105 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTAFRP25105 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTAFRP25105 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTAFRP25105 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTAFRP25105 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTAFRP25105 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTAFRP25105 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTAFRP25105 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTAFRP25105 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTAFRP25105 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTAFRP25105 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTAFRP25105 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTAFRP25105 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTAFRP25105 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTAFRP25105 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTAFRP25105 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTAFRP25105 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTAFRP25105 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms