Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPREP23469 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPREP23469 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPREP23469 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPREP23469 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPREP23469 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPREP23469 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPREP23469 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPREP23469 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPREP23469 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPREP23469 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPREP23469 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPREP23469 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPREP23469 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPREP23469 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPREP23469 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPREP23469 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPREP23469 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPREP23469 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPREP23469 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPREP23469 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPREP23469 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPREP23469 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPREP23469 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPREP23469 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPREP23469 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPREP23469 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPREP23469 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPREP23469 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPREP23469 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPREP23469 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPREP23469 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPREP23469 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPREP23469 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPREP23469 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPREP23469 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPREP23469 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPREP23469 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPREP23469 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPREP23469 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPREP23469 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPREP23469 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPREP23469 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPREP23469 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPREP23469 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPREP23469 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPREP23469 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPREP23469 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPREP23469 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPREP23469 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPREP23469 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPREP23469 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPREP23469 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTPREP23469 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
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