Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RPS6KB1P23443 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPS6KB1P23443 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPS6KB1P23443 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms