Protein–RNA interactions for Protein: P23083

IGHV1-2, Immunoglobulin heavy variable 1-2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-2P23083 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHV1-2P23083 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHV1-2P23083 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHV1-2P23083 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms