Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP8P22894 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP8P22894 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MMP8P22894 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP8P22894 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MMP8P22894 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP8P22894 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP8P22894 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP8P22894 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP8P22894 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP8P22894 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP8P22894 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP8P22894 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP8P22894 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP8P22894 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP8P22894 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP8P22894 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP8P22894 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP8P22894 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP8P22894 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP8P22894 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP8P22894 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP8P22894 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP8P22894 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP8P22894 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP8P22894 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP8P22894 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP8P22894 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP8P22894 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP8P22894 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP8P22894 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP8P22894 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP8P22894 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP8P22894 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP8P22894 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MMP8P22894 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP8P22894 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP8P22894 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP8P22894 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP8P22894 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MMP8P22894 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MMP8P22894 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP8P22894 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP8P22894 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MMP8P22894 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MMP8P22894 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP8P22894 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP8P22894 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP8P22894 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MMP8P22894 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MMP8P22894 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MMP8P22894 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP8P22894 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP8P22894 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MMP8P22894 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms