Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LHCGRP22888 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LHCGRP22888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHCGRP22888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHCGRP22888 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms