Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RFX1P22670 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX1P22670 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX1P22670 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX1P22670 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RFX1P22670 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX1P22670 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX1P22670 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX1P22670 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX1P22670 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX1P22670 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RFX1P22670 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX1P22670 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX1P22670 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX1P22670 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RFX1P22670 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RFX1P22670 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX1P22670 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RFX1P22670 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RFX1P22670 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RFX1P22670 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RFX1P22670 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RFX1P22670 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RFX1P22670 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RFX1P22670 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RFX1P22670 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX1P22670 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX1P22670 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX1P22670 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RFX1P22670 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX1P22670 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX1P22670 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX1P22670 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX1P22670 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RFX1P22670 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX1P22670 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RFX1P22670 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFX1P22670 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RFX1P22670 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX1P22670 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX1P22670 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX1P22670 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX1P22670 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX1P22670 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RFX1P22670 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RFX1P22670 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RFX1P22670 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFX1P22670 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFX1P22670 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFX1P22670 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFX1P22670 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RFX1P22670 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFX1P22670 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RFX1P22670 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX1P22670 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX1P22670 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX1P22670 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX1P22670 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX1P22670 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RFX1P22670 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFX1P22670 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFX1P22670 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFX1P22670 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RFX1P22670 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RFX1P22670 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RFX1P22670 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFX1P22670 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFX1P22670 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFX1P22670 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFX1P22670 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RFX1P22670 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms