Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FGFR3P22607 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FGFR3P22607 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FGFR3P22607 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGFR3P22607 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms