Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCMT1P22061 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCMT1P22061 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCMT1P22061 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms