Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHBP21912 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHBP21912 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHBP21912 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDHBP21912 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDHBP21912 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHBP21912 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHBP21912 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHBP21912 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHBP21912 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHBP21912 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDHBP21912 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDHBP21912 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHBP21912 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHBP21912 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHBP21912 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDHBP21912 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHBP21912 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHBP21912 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDHBP21912 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHBP21912 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHBP21912 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHBP21912 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHBP21912 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDHBP21912 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHBP21912 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHBP21912 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHBP21912 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHBP21912 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHBP21912 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDHBP21912 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHBP21912 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHBP21912 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHBP21912 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHBP21912 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDHBP21912 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHBP21912 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHBP21912 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHBP21912 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDHBP21912 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHBP21912 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHBP21912 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHBP21912 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHBP21912 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHBP21912 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDHBP21912 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDHBP21912 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDHBP21912 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHBP21912 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDHBP21912 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDHBP21912 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHBP21912 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHBP21912 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDHBP21912 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHBP21912 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHBP21912 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHBP21912 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHBP21912 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDHBP21912 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHBP21912 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHBP21912 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHBP21912 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHBP21912 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDHBP21912 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHBP21912 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDHBP21912 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHBP21912 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDHBP21912 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHBP21912 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHBP21912 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHBP21912 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDHBP21912 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHBP21912 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHBP21912 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDHBP21912 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms