Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CASTP20810 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASTP20810 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASTP20810 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CASTP20810 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CASTP20810 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASTP20810 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASTP20810 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASTP20810 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CASTP20810 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASTP20810 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CASTP20810 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CASTP20810 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CASTP20810 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CASTP20810 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CASTP20810 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CASTP20810 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASTP20810 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASTP20810 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASTP20810 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASTP20810 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASTP20810 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASTP20810 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASTP20810 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASTP20810 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASTP20810 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASTP20810 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASTP20810 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASTP20810 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CASTP20810 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASTP20810 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASTP20810 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASTP20810 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASTP20810 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASTP20810 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CASTP20810 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASTP20810 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASTP20810 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASTP20810 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASTP20810 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASTP20810 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASTP20810 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASTP20810 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASTP20810 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASTP20810 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASTP20810 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CASTP20810 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASTP20810 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASTP20810 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASTP20810 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASTP20810 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASTP20810 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASTP20810 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASTP20810 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASTP20810 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASTP20810 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASTP20810 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CASTP20810 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASTP20810 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASTP20810 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASTP20810 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASTP20810 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms