Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXA5P20719 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA5P20719 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA5P20719 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA5P20719 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms