Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF1BP20333 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF1BP20333 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF1BP20333 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF1BP20333 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms