Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CXCL2P19875 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CXCL2P19875 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CXCL2P19875 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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