Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT4P19013 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT4P19013 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT4P19013 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT4P19013 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT4P19013 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT4P19013 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT4P19013 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT4P19013 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT4P19013 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT4P19013 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT4P19013 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT4P19013 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT4P19013 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT4P19013 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT4P19013 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT4P19013 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT4P19013 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT4P19013 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT4P19013 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT4P19013 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT4P19013 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT4P19013 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT4P19013 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT4P19013 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT4P19013 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRT4P19013 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT4P19013 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT4P19013 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT4P19013 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT4P19013 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT4P19013 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT4P19013 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT4P19013 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT4P19013 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT4P19013 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT4P19013 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT4P19013 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT4P19013 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT4P19013 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT4P19013 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT4P19013 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT4P19013 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT4P19013 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT4P19013 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT4P19013 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT4P19013 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT4P19013 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT4P19013 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT4P19013 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT4P19013 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT4P19013 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT4P19013 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT4P19013 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT4P19013 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT4P19013 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT4P19013 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT4P19013 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT4P19013 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT4P19013 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT4P19013 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT4P19013 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT4P19013 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT4P19013 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT4P19013 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT4P19013 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT4P19013 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT4P19013 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT4P19013 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT4P19013 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT4P19013 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT4P19013 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT4P19013 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT4P19013 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT4P19013 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT4P19013 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT4P19013 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT4P19013 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT4P19013 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT4P19013 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT4P19013 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT4P19013 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT4P19013 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT4P19013 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT4P19013 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT4P19013 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT4P19013 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms