Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AMD1P17707 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMD1P17707 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMD1P17707 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMD1P17707 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AMD1P17707 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMD1P17707 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMD1P17707 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AMD1P17707 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMD1P17707 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMD1P17707 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AMD1P17707 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AMD1P17707 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AMD1P17707 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMD1P17707 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMD1P17707 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMD1P17707 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMD1P17707 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AMD1P17707 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMD1P17707 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMD1P17707 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMD1P17707 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMD1P17707 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMD1P17707 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AMD1P17707 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AMD1P17707 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AMD1P17707 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMD1P17707 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AMD1P17707 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMD1P17707 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AMD1P17707 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AMD1P17707 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AMD1P17707 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMD1P17707 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMD1P17707 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMD1P17707 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMD1P17707 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMD1P17707 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AMD1P17707 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AMD1P17707 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AMD1P17707 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AMD1P17707 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMD1P17707 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMD1P17707 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMD1P17707 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AMD1P17707 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMD1P17707 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AMD1P17707 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AMD1P17707 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMD1P17707 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMD1P17707 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AMD1P17707 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMD1P17707 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMD1P17707 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMD1P17707 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMD1P17707 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AMD1P17707 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMD1P17707 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMD1P17707 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMD1P17707 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMD1P17707 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMD1P17707 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AMD1P17707 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMD1P17707 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMD1P17707 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AMD1P17707 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMD1P17707 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMD1P17707 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMD1P17707 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AMD1P17707 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AMD1P17707 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMD1P17707 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AMD1P17707 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMD1P17707 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMD1P17707 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AMD1P17707 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AMD1P17707 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AMD1P17707 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms