Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCFC2P16383 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GCFC2P16383 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCFC2P16383 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCFC2P16383 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms