Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TIMP2P16035 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TIMP2P16035 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TIMP2P16035 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TIMP2P16035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms