Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFAPP14136 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GFAPP14136 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GFAPP14136 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFAPP14136 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GFAPP14136 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFAPP14136 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFAPP14136 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFAPP14136 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFAPP14136 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFAPP14136 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFAPP14136 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GFAPP14136 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFAPP14136 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFAPP14136 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GFAPP14136 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFAPP14136 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFAPP14136 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFAPP14136 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFAPP14136 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GFAPP14136 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GFAPP14136 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFAPP14136 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFAPP14136 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFAPP14136 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFAPP14136 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFAPP14136 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GFAPP14136 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GFAPP14136 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GFAPP14136 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.6 ms