Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KRT5P13647 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KRT5P13647 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT5P13647 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT5P13647 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KRT5P13647 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KRT5P13647 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT5P13647 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT5P13647 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KRT5P13647 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT5P13647 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT5P13647 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT5P13647 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KRT5P13647 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KRT5P13647 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT5P13647 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT5P13647 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT5P13647 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT5P13647 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KRT5P13647 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT5P13647 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT5P13647 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT5P13647 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KRT5P13647 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT5P13647 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KRT5P13647 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT5P13647 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT5P13647 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KRT5P13647 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT5P13647 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT5P13647 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KRT5P13647 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT5P13647 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KRT5P13647 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KRT5P13647 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT5P13647 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT5P13647 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT5P13647 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT5P13647 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT5P13647 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KRT5P13647 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KRT5P13647 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KRT5P13647 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT5P13647 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KRT5P13647 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT5P13647 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT5P13647 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT5P13647 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KRT5P13647 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT5P13647 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT5P13647 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT5P13647 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT5P13647 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT5P13647 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KRT5P13647 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT5P13647 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT5P13647 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT5P13647 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT5P13647 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KRT5P13647 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT5P13647 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT5P13647 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT5P13647 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT5P13647 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KRT5P13647 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms