Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NR2C1P13056 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NR2C1P13056 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR2C1P13056 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR2C1P13056 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms