Protein–RNA interactions for Protein: P12931

SRC, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCP12931 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRCP12931 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRCP12931 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRCP12931 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRCP12931 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRCP12931 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRCP12931 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRCP12931 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRCP12931 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRCP12931 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRCP12931 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SRCP12931 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRCP12931 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRCP12931 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SRCP12931 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRCP12931 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRCP12931 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRCP12931 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRCP12931 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRCP12931 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRCP12931 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRCP12931 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRCP12931 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRCP12931 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRCP12931 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRCP12931 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRCP12931 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRCP12931 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCP12931 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCP12931 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCP12931 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCP12931 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCP12931 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRCP12931 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCP12931 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCP12931 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCP12931 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRCP12931 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCP12931 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCP12931 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCP12931 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRCP12931 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCP12931 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCP12931 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCP12931 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRCP12931 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCP12931 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRCP12931 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCP12931 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCP12931 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRCP12931 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCP12931 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCP12931 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCP12931 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRCP12931 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRCP12931 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRCP12931 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCP12931 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SRCP12931 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCP12931 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCP12931 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SRCP12931 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRCP12931 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCP12931 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCP12931 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRCP12931 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCP12931 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCP12931 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCP12931 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCP12931 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRCP12931 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRCP12931 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRCP12931 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms