Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ESRRAP11474 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ESRRAP11474 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ESRRAP11474 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ESRRAP11474 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms