Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP1P11387 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP1P11387 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP1P11387 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP1P11387 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP1P11387 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP1P11387 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP1P11387 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP1P11387 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP1P11387 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP1P11387 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP1P11387 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP1P11387 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP1P11387 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP1P11387 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP1P11387 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOP1P11387 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOP1P11387 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP1P11387 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP1P11387 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP1P11387 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOP1P11387 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP1P11387 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP1P11387 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP1P11387 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOP1P11387 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP1P11387 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP1P11387 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP1P11387 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP1P11387 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOP1P11387 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP1P11387 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TOP1P11387 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOP1P11387 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TOP1P11387 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP1P11387 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP1P11387 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP1P11387 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOP1P11387 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP1P11387 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP1P11387 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP1P11387 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOP1P11387 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP1P11387 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP1P11387 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP1P11387 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP1P11387 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP1P11387 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP1P11387 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP1P11387 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP1P11387 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP1P11387 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP1P11387 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP1P11387 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP1P11387 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP1P11387 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP1P11387 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP1P11387 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP1P11387 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP1P11387 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP1P11387 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP1P11387 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP1P11387 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP1P11387 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP1P11387 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP1P11387 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP1P11387 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP1P11387 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP1P11387 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP1P11387 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP1P11387 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP1P11387 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOP1P11387 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP1P11387 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms