Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LAMC1P11047 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LAMC1P11047 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
LAMC1P11047 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LAMC1P11047 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LAMC1P11047 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms