Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHGAP10645 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHGAP10645 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CHGAP10645 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHGAP10645 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
CHGAP10645 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHGAP10645 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHGAP10645 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHGAP10645 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHGAP10645 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CHGAP10645 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHGAP10645 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CHGAP10645 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHGAP10645 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHGAP10645 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHGAP10645 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHGAP10645 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CHGAP10645 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CHGAP10645 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHGAP10645 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHGAP10645 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CHGAP10645 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHGAP10645 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CHGAP10645 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CHGAP10645 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
CHGAP10645 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CHGAP10645 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
CHGAP10645 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHGAP10645 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CHGAP10645 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHGAP10645 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHGAP10645 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHGAP10645 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHGAP10645 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CHGAP10645 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHGAP10645 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHGAP10645 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHGAP10645 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHGAP10645 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CHGAP10645 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CHGAP10645 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHGAP10645 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHGAP10645 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHGAP10645 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHGAP10645 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CHGAP10645 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHGAP10645 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CHGAP10645 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHGAP10645 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CHGAP10645 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHGAP10645 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CHGAP10645 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHGAP10645 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHGAP10645 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHGAP10645 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CHGAP10645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHGAP10645 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CHGAP10645 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
CHGAP10645 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CHGAP10645 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHGAP10645 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CHGAP10645 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHGAP10645 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CHGAP10645 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHGAP10645 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHGAP10645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHGAP10645 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHGAP10645 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CHGAP10645 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
CHGAP10645 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHGAP10645 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHGAP10645 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHGAP10645 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHGAP10645 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHGAP10645 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CHGAP10645 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CHGAP10645 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHGAP10645 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHGAP10645 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHGAP10645 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHGAP10645 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHGAP10645 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CHGAP10645 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CHGAP10645 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms