Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX5BP10606 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX5BP10606 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX5BP10606 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX5BP10606 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX5BP10606 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX5BP10606 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX5BP10606 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX5BP10606 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX5BP10606 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX5BP10606 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX5BP10606 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COX5BP10606 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX5BP10606 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX5BP10606 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX5BP10606 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COX5BP10606 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX5BP10606 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COX5BP10606 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX5BP10606 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX5BP10606 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COX5BP10606 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COX5BP10606 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX5BP10606 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX5BP10606 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX5BP10606 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX5BP10606 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COX5BP10606 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX5BP10606 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COX5BP10606 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX5BP10606 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COX5BP10606 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COX5BP10606 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COX5BP10606 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COX5BP10606 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX5BP10606 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX5BP10606 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX5BP10606 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COX5BP10606 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX5BP10606 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COX5BP10606 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX5BP10606 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX5BP10606 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX5BP10606 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COX5BP10606 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COX5BP10606 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms