Protein–RNA interactions for Protein: P0CG21

NHLRC4, NHL-repeat-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC4P0CG21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC4P0CG21 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC4P0CG21 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NHLRC4P0CG21 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHLRC4P0CG21 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHLRC4P0CG21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NHLRC4P0CG21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC4P0CG21 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NHLRC4P0CG21 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NHLRC4P0CG21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms