Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P2

RFPL3S, Putative protein RFPL3S, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3SP0C7P2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFPL3SP0C7P2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFPL3SP0C7P2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFPL3SP0C7P2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFPL3SP0C7P2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms