Protein–RNA interactions for Protein: P08590

MYL3, Myosin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL3P08590 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYL3P08590 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL3P08590 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MYL3P08590 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL3P08590 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MYL3P08590 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYL3P08590 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MYL3P08590 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MYL3P08590 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYL3P08590 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MYL3P08590 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYL3P08590 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MYL3P08590 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MYL3P08590 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MYL3P08590 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL3P08590 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MYL3P08590 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MYL3P08590 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MYL3P08590 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL3P08590 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MYL3P08590 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYL3P08590 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYL3P08590 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MYL3P08590 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYL3P08590 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MYL3P08590 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MYL3P08590 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL3P08590 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL3P08590 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL3P08590 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MYL3P08590 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MYL3P08590 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYL3P08590 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL3P08590 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL3P08590 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYL3P08590 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL3P08590 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL3P08590 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL3P08590 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL3P08590 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYL3P08590 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYL3P08590 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL3P08590 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL3P08590 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL3P08590 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYL3P08590 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL3P08590 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYL3P08590 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYL3P08590 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL3P08590 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL3P08590 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL3P08590 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYL3P08590 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL3P08590 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL3P08590 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL3P08590 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL3P08590 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL3P08590 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYL3P08590 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL3P08590 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYL3P08590 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL3P08590 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL3P08590 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL3P08590 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL3P08590 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYL3P08590 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL3P08590 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL3P08590 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL3P08590 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL3P08590 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL3P08590 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL3P08590 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL3P08590 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL3P08590 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL3P08590 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL3P08590 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL3P08590 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms