Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP1P08047 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP1P08047 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP1P08047 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SP1P08047 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP1P08047 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP1P08047 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP1P08047 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP1P08047 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SP1P08047 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP1P08047 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP1P08047 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP1P08047 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP1P08047 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP1P08047 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SP1P08047 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP1P08047 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SP1P08047 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP1P08047 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP1P08047 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SP1P08047 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP1P08047 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP1P08047 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SP1P08047 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP1P08047 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP1P08047 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP1P08047 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP1P08047 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP1P08047 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP1P08047 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP1P08047 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP1P08047 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP1P08047 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP1P08047 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SP1P08047 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP1P08047 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SP1P08047 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP1P08047 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP1P08047 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP1P08047 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP1P08047 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP1P08047 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP1P08047 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP1P08047 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP1P08047 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP1P08047 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SP1P08047 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP1P08047 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP1P08047 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP1P08047 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SP1P08047 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SP1P08047 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP1P08047 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP1P08047 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SP1P08047 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SP1P08047 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP1P08047 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SP1P08047 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP1P08047 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SP1P08047 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SP1P08047 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP1P08047 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SP1P08047 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP1P08047 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP1P08047 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SP1P08047 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP1P08047 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP1P08047 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms