Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CSF1RP07333 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
CSF1RP07333 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CSF1RP07333 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSF1RP07333 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms