Protein–RNA interactions for Protein: P07305

H1F0, Histone H1.0, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1F0P07305 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H1F0P07305 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H1F0P07305 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H1F0P07305 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H1F0P07305 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H1F0P07305 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1F0P07305 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1F0P07305 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1F0P07305 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1F0P07305 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H1F0P07305 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H1F0P07305 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H1F0P07305 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H1F0P07305 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H1F0P07305 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1F0P07305 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1F0P07305 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1F0P07305 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1F0P07305 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H1F0P07305 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H1F0P07305 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H1F0P07305 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H1F0P07305 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1F0P07305 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1F0P07305 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1F0P07305 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1F0P07305 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1F0P07305 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H1F0P07305 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1F0P07305 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1F0P07305 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1F0P07305 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1F0P07305 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1F0P07305 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H1F0P07305 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H1F0P07305 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H1F0P07305 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
H1F0P07305 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H1F0P07305 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H1F0P07305 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H1F0P07305 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H1F0P07305 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H1F0P07305 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H1F0P07305 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H1F0P07305 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H1F0P07305 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H1F0P07305 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H1F0P07305 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H1F0P07305 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H1F0P07305 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H1F0P07305 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms