Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEFLP07196 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEFLP07196 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEFLP07196 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NEFLP07196 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NEFLP07196 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFLP07196 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFLP07196 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFLP07196 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFLP07196 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEFLP07196 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFLP07196 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFLP07196 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEFLP07196 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFLP07196 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFLP07196 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFLP07196 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEFLP07196 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFLP07196 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFLP07196 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFLP07196 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFLP07196 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEFLP07196 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEFLP07196 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEFLP07196 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEFLP07196 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEFLP07196 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEFLP07196 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEFLP07196 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFLP07196 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEFLP07196 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEFLP07196 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFLP07196 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFLP07196 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFLP07196 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFLP07196 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFLP07196 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFLP07196 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFLP07196 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFLP07196 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFLP07196 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFLP07196 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFLP07196 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFLP07196 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFLP07196 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEFLP07196 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFLP07196 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFLP07196 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFLP07196 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFLP07196 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEFLP07196 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFLP07196 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFLP07196 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFLP07196 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
NEFLP07196 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFLP07196 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFLP07196 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFLP07196 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEFLP07196 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFLP07196 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFLP07196 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFLP07196 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEFLP07196 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEFLP07196 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFLP07196 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFLP07196 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFLP07196 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFLP07196 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFLP07196 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEFLP07196 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEFLP07196 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NEFLP07196 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
NEFLP07196 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NEFLP07196 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NEFLP07196 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEFLP07196 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEFLP07196 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEFLP07196 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NEFLP07196 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NEFLP07196 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32■■■□□ 2.71
NEFLP07196 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms