Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LPLP06858 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LPLP06858 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LPLP06858 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LPLP06858 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPLP06858 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPLP06858 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPLP06858 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LPLP06858 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPLP06858 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPLP06858 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPLP06858 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPLP06858 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPLP06858 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPLP06858 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LPLP06858 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPLP06858 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPLP06858 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPLP06858 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPLP06858 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPLP06858 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPLP06858 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPLP06858 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LPLP06858 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LPLP06858 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LPLP06858 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LPLP06858 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LPLP06858 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LPLP06858 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LPLP06858 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LPLP06858 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LPLP06858 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LPLP06858 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LPLP06858 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LPLP06858 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPLP06858 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPLP06858 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPLP06858 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPLP06858 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LPLP06858 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms