Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CFIP05156 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFIP05156 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFIP05156 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CFIP05156 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFIP05156 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFIP05156 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFIP05156 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CFIP05156 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFIP05156 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFIP05156 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFIP05156 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CFIP05156 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CFIP05156 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFIP05156 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFIP05156 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFIP05156 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFIP05156 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFIP05156 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFIP05156 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFIP05156 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFIP05156 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFIP05156 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFIP05156 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFIP05156 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFIP05156 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFIP05156 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFIP05156 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFIP05156 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFIP05156 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFIP05156 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFIP05156 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFIP05156 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFIP05156 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFIP05156 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFIP05156 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFIP05156 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFIP05156 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFIP05156 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFIP05156 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFIP05156 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFIP05156 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFIP05156 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFIP05156 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFIP05156 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFIP05156 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFIP05156 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFIP05156 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFIP05156 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFIP05156 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFIP05156 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFIP05156 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFIP05156 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFIP05156 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFIP05156 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFIP05156 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFIP05156 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFIP05156 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms