Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IFNA4P05014 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IFNA4P05014 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
IFNA4P05014 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms