Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNW1P05000 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFNW1P05000 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFNW1P05000 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNW1P05000 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms