Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRM2P04554 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRM2P04554 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRM2P04554 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRM2P04554 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRM2P04554 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRM2P04554 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRM2P04554 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRM2P04554 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRM2P04554 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRM2P04554 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRM2P04554 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRM2P04554 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRM2P04554 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRM2P04554 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRM2P04554 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRM2P04554 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRM2P04554 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRM2P04554 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRM2P04554 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRM2P04554 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRM2P04554 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRM2P04554 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRM2P04554 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRM2P04554 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRM2P04554 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PRM2P04554 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRM2P04554 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms