Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT6BP04259 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT6BP04259 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT6BP04259 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms