Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2P04141 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2P04141 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF2P04141 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF2P04141 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF2P04141 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2P04141 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF2P04141 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2P04141 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2P04141 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2P04141 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2P04141 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF2P04141 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF2P04141 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF2P04141 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF2P04141 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF2P04141 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF2P04141 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF2P04141 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF2P04141 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF2P04141 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF2P04141 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF2P04141 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF2P04141 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF2P04141 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF2P04141 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF2P04141 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF2P04141 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF2P04141 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF2P04141 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF2P04141 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF2P04141 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF2P04141 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF2P04141 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF2P04141 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF2P04141 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF2P04141 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF2P04141 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF2P04141 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF2P04141 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF2P04141 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF2P04141 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF2P04141 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF2P04141 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF2P04141 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF2P04141 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF2P04141 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF2P04141 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF2P04141 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF2P04141 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF2P04141 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF2P04141 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF2P04141 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSF2P04141 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF2P04141 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF2P04141 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF2P04141 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF2P04141 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF2P04141 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF2P04141 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF2P04141 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF2P04141 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF2P04141 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF2P04141 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF2P04141 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF2P04141 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF2P04141 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF2P04141 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF2P04141 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF2P04141 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF2P04141 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF2P04141 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF2P04141 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms