Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOA1P02647 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOA1P02647 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOA1P02647 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOA1P02647 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOA1P02647 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOA1P02647 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOA1P02647 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA1P02647 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA1P02647 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA1P02647 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA1P02647 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA1P02647 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA1P02647 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA1P02647 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA1P02647 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA1P02647 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA1P02647 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA1P02647 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA1P02647 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA1P02647 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOA1P02647 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA1P02647 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA1P02647 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA1P02647 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA1P02647 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA1P02647 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOA1P02647 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA1P02647 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA1P02647 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOA1P02647 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA1P02647 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOA1P02647 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA1P02647 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA1P02647 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA1P02647 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOA1P02647 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms