Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGHV3-33P01772 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGHV3-33P01772 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGHV3-33P01772 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms