Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EGFRP00533 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EGFRP00533 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EGFRP00533 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EGFRP00533 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EGFRP00533 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EGFRP00533 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
EGFRP00533 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EGFRP00533 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
EGFRP00533 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EGFRP00533 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EGFRP00533 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EGFRP00533 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EGFRP00533 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
EGFRP00533 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EGFRP00533 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EGFRP00533 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EGFRP00533 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EGFRP00533 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EGFRP00533 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EGFRP00533 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EGFRP00533 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EGFRP00533 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EGFRP00533 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EGFRP00533 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EGFRP00533 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EGFRP00533 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EGFRP00533 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EGFRP00533 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EGFRP00533 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EGFRP00533 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EGFRP00533 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EGFRP00533 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EGFRP00533 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EGFRP00533 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EGFRP00533 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EGFRP00533 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EGFRP00533 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EGFRP00533 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EGFRP00533 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EGFRP00533 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
EGFRP00533 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EGFRP00533 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EGFRP00533 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EGFRP00533 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EGFRP00533 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EGFRP00533 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EGFRP00533 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EGFRP00533 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EGFRP00533 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EGFRP00533 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EGFRP00533 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EGFRP00533 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
EGFRP00533 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EGFRP00533 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EGFRP00533 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EGFRP00533 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EGFRP00533 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
EGFRP00533 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EGFRP00533 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EGFRP00533 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EGFRP00533 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EGFRP00533 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EGFRP00533 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EGFRP00533 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EGFRP00533 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EGFRP00533 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms