Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX58O95786 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX58O95786 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX58O95786 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX58O95786 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX58O95786 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DDX58O95786 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX58O95786 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX58O95786 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
DDX58O95786 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDX58O95786 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DDX58O95786 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX58O95786 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX58O95786 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX58O95786 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX58O95786 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DDX58O95786 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX58O95786 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX58O95786 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX58O95786 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX58O95786 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DDX58O95786 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DDX58O95786 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX58O95786 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
DDX58O95786 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX58O95786 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX58O95786 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DDX58O95786 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX58O95786 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX58O95786 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX58O95786 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DDX58O95786 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDX58O95786 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DDX58O95786 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX58O95786 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX58O95786 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX58O95786 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX58O95786 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DDX58O95786 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DDX58O95786 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX58O95786 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX58O95786 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX58O95786 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX58O95786 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX58O95786 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DDX58O95786 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX58O95786 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX58O95786 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX58O95786 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX58O95786 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX58O95786 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DDX58O95786 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX58O95786 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX58O95786 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX58O95786 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX58O95786 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
DDX58O95786 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX58O95786 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX58O95786 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX58O95786 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX58O95786 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
DDX58O95786 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDX58O95786 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDX58O95786 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
DDX58O95786 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX58O95786 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX58O95786 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
DDX58O95786 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDX58O95786 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDX58O95786 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDX58O95786 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
DDX58O95786 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX58O95786 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX58O95786 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX58O95786 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX58O95786 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX58O95786 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
DDX58O95786 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
DDX58O95786 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
DDX58O95786 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
DDX58O95786 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
DDX58O95786 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDX58O95786 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
DDX58O95786 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
DDX58O95786 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
DDX58O95786 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms