Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP4O95707 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP4O95707 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP4O95707 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POP4O95707 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POP4O95707 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP4O95707 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP4O95707 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP4O95707 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP4O95707 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP4O95707 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POP4O95707 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP4O95707 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP4O95707 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP4O95707 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POP4O95707 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POP4O95707 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP4O95707 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP4O95707 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POP4O95707 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POP4O95707 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POP4O95707 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POP4O95707 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POP4O95707 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP4O95707 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP4O95707 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP4O95707 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POP4O95707 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POP4O95707 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POP4O95707 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POP4O95707 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP4O95707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POP4O95707 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
POP4O95707 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POP4O95707 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP4O95707 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POP4O95707 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POP4O95707 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
POP4O95707 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POP4O95707 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POP4O95707 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP4O95707 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP4O95707 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP4O95707 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POP4O95707 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POP4O95707 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
POP4O95707 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP4O95707 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP4O95707 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POP4O95707 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP4O95707 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP4O95707 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP4O95707 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POP4O95707 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP4O95707 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP4O95707 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP4O95707 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP4O95707 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POP4O95707 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POP4O95707 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP4O95707 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP4O95707 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP4O95707 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POP4O95707 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP4O95707 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POP4O95707 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms