Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBB3O95704 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APBB3O95704 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBB3O95704 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBB3O95704 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APBB3O95704 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APBB3O95704 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APBB3O95704 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APBB3O95704 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APBB3O95704 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APBB3O95704 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBB3O95704 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APBB3O95704 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBB3O95704 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBB3O95704 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APBB3O95704 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APBB3O95704 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBB3O95704 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBB3O95704 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBB3O95704 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APBB3O95704 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APBB3O95704 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBB3O95704 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBB3O95704 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBB3O95704 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBB3O95704 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APBB3O95704 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBB3O95704 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBB3O95704 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBB3O95704 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APBB3O95704 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APBB3O95704 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
APBB3O95704 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBB3O95704 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBB3O95704 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBB3O95704 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APBB3O95704 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APBB3O95704 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBB3O95704 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBB3O95704 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBB3O95704 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APBB3O95704 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBB3O95704 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APBB3O95704 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APBB3O95704 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBB3O95704 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBB3O95704 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBB3O95704 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBB3O95704 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
APBB3O95704 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APBB3O95704 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBB3O95704 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBB3O95704 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBB3O95704 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBB3O95704 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APBB3O95704 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APBB3O95704 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APBB3O95704 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBB3O95704 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBB3O95704 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBB3O95704 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBB3O95704 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APBB3O95704 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBB3O95704 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBB3O95704 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBB3O95704 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBB3O95704 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBB3O95704 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APBB3O95704 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBB3O95704 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APBB3O95704 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APBB3O95704 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBB3O95704 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBB3O95704 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBB3O95704 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APBB3O95704 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APBB3O95704 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms